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<script type="text/javascript"> // ici votre programme en javascript </script>
<script type="text/javascript" src="script.js"></script>dans ce dernier cas on place généralement la directive dans la section head de la page html. L'avantage de cette méthode est que le fichier ne sera chargé qu'une seule fois par le navigateur et stocké dans son cache si il apparait dans plusieurs pages.